首先，美国的全球“反恐战争”并不纯粹，背后隐藏着诸多其他意图，带有明显的推行美国战略意图的倾向。美国出于国家利益的考虑，把反恐问题工具化，历届美国总统或决策者为“全球反恐战争”叠加了更多战略目标，如在目标国复制美国政体并推行“民主化”；推动当地社会的“世俗化”、“现代化”；利用其他国家的民族分离主义和恐怖主义势力牵制其他大国的崛起，借“全球反恐”的名义党同伐异，巩固自己全球霸权。当 “反恐”和“维霸”这两个本应清晰、本应泾渭分明的关键概念被刻意混淆时，就从逻辑上注定了这场反恐战争注定会无果而终。
此外，美国顽固坚持双重标准，以关系亲疏而不是恐怖主义本身来定义敌我关系。如果某个国家或政权侵害了自身利益，就将其贴上贴上 “支持恐怖主义”标签，借“反恐”之名予以颠覆；而某个组织或政权对其有利的话，即便是出现恐怖袭击等行为，也以人权、民主等借口为其开脱，甚至提供庇护和资助，从而使得恐怖主义标准混乱，各种形形色色的恐怖主义组织大肆发展，如雨后春笋般出现，形成了“越反越恐”的现象。例如，据数据显示，近20年来，阿境内的恐怖组织数量非但没有减少，反而从个位数增加到20多个，境内的外国恐怖分子近1万人。